Дочь писателя родилась в Иркутске 8 мая 1971 года.

После окончания в 1990 году музыкального отделения Иркутского училища искусств (по классам теории музыки и фортепиано) Мария поступила в Московскую государственную консерваторию им. П.И.Чайковского, где училась как музыковед и как органистка. Ее дипломная работа, написанная под руководством доктора искусствоведения, профессора Е.М.Левашева, была посвящена теории древнерусской музыки — изучению и прочтению знаменной нотации. С 1996 по 1999 год Мария училась в аспирантуре Московской консерватории по этим же двум специальностям, а в 1997–1998 году стажировалась в Любеке (ФРГ) у известного органиста, профессора М. Хазельбёка, одновременно занимаясь и своей научной работой. В 2002 году она защитила кандидатскую диссертацию на тему «Становление клавирного стиля в музыке южнонемецкого барокко» (издана посмертно: М., 2009). 

Еще студенткой пятого курса Мария пришла работать в Редакционно-издательский отдел консерватории, который возглавила в 2004 году, а с 1999 года начала преподавать, став ассистентом и правой рукой двух главных своих учителей — профессора Сергея Леонидовича Дижура (класс органа) и доктора искусствоведения, профессора Евгения Владимировича Назайкинского (спецкурс "Анализ музыкальных произведений"). Она также преподавала полифонию, а еще разработала и начала читать собственный авторский курс "История органного искусства".

Помимо преподавания, научной и издательской деятельности, Мария Валентиновна Распутина много выступала как органистка, а в последние годы активно участвовала в мастер-классах известных органистов в России и за рубежом. 

9 июля 2006 года, в возрасте 35 лет, Мария Валентиновна Распутина погибла в авиакатастрофе в аэропорту Иркутска. 

Она была редким по глубине, тонкости и душевной красоте человеком, и в памяти тех, кто ее знал, оставила неизгладимый след.

В творчестве отца памятником ей стал один из лучших его рассказов — «Что передать вороне?» (1981).